Die von MANDANTwin verwendete Zugriffsmethode für Datensätze einer Datei, die sowohl (sortiert) sequentiellen als auch wahlfreien (random) index-basierten Zugriff zulässt, sog. Index Sequential Access Method (ISAM), wird von Cloud-Systemen nicht unterstützt. Daher können die MANDANTwin-Datenbanken nicht in die Cloud verlagert werden.
Unbeschadet hiervon kann die Cloud als Sicherungsmedium genutzt werden.